New York City est secouée par une série d'incidents mystérieux orchestrés par l'énigmatique Enigma Order. Les Guardians, l'élite des héros, doivent déjouer ces plans tout en affrontant les vilains de l'Underground Syndicate. Les étudiants des académies de héros se retrouvent aussi impliqués, apprenant que leur formation est cruciale pour la survie de la ville. Entre alliances précaires et trahisons, chaque faction doit naviguer dans un climat de tension et d'incertitude pour préserver l'avenir de New York.